IBM kaupallistaa genomien lukemista

IBM on solminut lääketieteellisten laitteiden valmistaja Roche, rakentaa edullinen laite, joka voi lukea ihmisen genomia, yhtiö ilmoitti torstaina.

Vaikka tekniikka voi olla vielä kymmenvuotias tai kauemmas kaupallistamisesta, sen päätyttyä sen pitäisi antaa jokaiselle lääkärille edullinen ja nopea tapa tutkimalla potilaan genomista meikkiä, sanoo IBM Researchin laskennallisen biologian ylimmän johtajan Ajay Royyuru.

"Genomin sekvensoinnin kustannukset ovat laskeneet ja nopeus on alkanut parantua, mutta nopeuden, asteikon, läpijuoksu sekä kustannukset ", Royyuru sanoi.

Projektissa käytetään IBM: n" DNA Transistoriä ". Nämä transistorit sisältävät nanoporeja, tai hyvin pieniä huokoset, joista jokainen osa voi olla deoksiribonukleiinihapon (DNA) juoste. Nanopore identifioi jokaisen DNA-emäksen käyttämällä sähkökenttää.

Koska nanopore on osittain valmistettu piistä, sen pitäisi pystyä tuottamaan massatuotteita samoilla litografiamenetelmillä, joita käytetään mikroprosessoreiden valmistuksessa, kustannukset alenevat, Royyuru sanoi.

Vaikka muut tutkijat ovat myös tutkineet nanoporeiden käyttöä, tällaiset mallit eivät voi tarkasti lukea DNA: ta, koska DNA kulkee liian nopeasti huokosten kautta.

"Se on kuin imemällä spagettia. aloittaa siirtymisen nanoporeen läpi, se menee todella nopeasti, olemme nähneet 48 000 yksikköä DNA: ta 10 tai 20 millisekunnissa, nopeudella sinulla on hyvin vähän mahdollisuuksia lukea tätä oikein ", Royyuru sanoi. nopeus DNA: lla, IBM on valmistanut nanoporeille sähköisen ohjauksen, joka rääkkää virtauksen haluttuun nopeuteen. "Voimme elektronisesti ohjata DNA: n liikkumista huokosten läpi, voimme siirtää yksikköä yksikköä kohti," hän sanoi.

Vaikka DNA-sekvensointitekniikat ovat olleet 1970-luvun alusta lähtien, koko ihmisen genomi ei dekoodauduttu kokonaisuudessaan vuoteen 2001 asti, koska automaatti tarvittiin lukemaan lukuisia peruspareja, jotka on luettava. Jokainen ihmisen DNA sisältää noin 3 miljardia peruspariä nukleotideja.

Vaikka DNA-sekvensointitekniikka on parantunut sitten, se maksaa edelleen muutamia satoja tuhansia dollareita koko ihmisen genomin lukemiseksi, Royyuru sanoi. Kun laite on valmis, tämän laitteen pitäisi pystyä tekemään työtä mihin tahansa $ 100 - $ 1,000 per lue, Royyuru arvioi.

Royyuru ei ole tarjonnut aikaa, jolloin kone olisi kaupallisesti saatavilla, viitaten moniin vaiheisiin, radikaalisti uutta teknologiaa tuotantoon. Hän arvioi, että tutkimukset saattavat kestää viidestä kymmeneen vuoteen.

Roche: n sekvensoiva tytäryhtiö, 454 Life Sciences, lopulta markkinoi tämän yhteistyön tuloksena syntyviä tuotteita. IBM kertoo kumppanuutensa asiantuntemuksesta rakennuselektroniikan ja tietohallinnon alalla, kun taas Roche soveltaa tietämystään lääketieteelliseen diagnostiikkaan ja genomin sekvensointiin, Royyuru sanoi.

Yksilön geneettisen koodin lukemisella voi olla useita lääketieteellisiä hyötyjä, Royyuru selitti. Erityisesti se sallii lääkäreiden "muokata lääketieteellisen hoidon tarjoamista", hän sanoi. Esimerkiksi monet lääkkeet toimivat joidenkin, mutta ei kaikkien, ihmisten kanssa. Ottaa ihmisen DNA kädessä auttaa lääkärin määräämään sopivaa lääkettä. Myös genomin lukeminen voi paljastaa alttiuden tietyille sairauksille.

Ehkä toista varhaista käyttöä voi olla, kun määritetään, kuinka kauan ihmiset elävät. Torstaina Boston Universityn tutkijat ilmoittivat, että he ovat löytäneet ne, jotka näyttävät olevan geneettisiä pitkäikäisyyden allekirjoituksia.

Joab Jackson käsittelee enterpise-ohjelmiston ja yleisen teknologian uutisia

IDG News Service. Seuraa Joab Twitterissä osoitteessa @Joab_Jackson. Joabin sähköpostiosoite on [email protected]